Museon nykyinen kompleksi, myös Jacques Herzogin ja Pierre de Meuronin teos, on heidän vuonna 1999 uudelleenrakentama viljamylly, joka on rakennettu 1900-luvun alussa. Sen päätyä ympäröivät hissin terässylinterit, jotka ilmestyivät 1930-luvulla; nyt se muuttuu myös näyttelytilaksi. Arkkitehtien mukaan aineelliset arvot oli aiemmin tallennettu sinne, nyt on henkisen vuoro.
Halu laajentaa museon tilaa johtui sen kokoelman kasvusta: Ströersin puolisoiden kokoelma lisättiin Grote-kokoelmaan (molemmat koostuivat saksalaisten johtavien taiteilijoiden teoksista, jotka luotiin vuoden 1945 jälkeen). Uudisrakentaminen oli myös yksi juhlavuoden 2010 valmisteluvaiheista - jolloin koko Ruhrin alueesta tulee Euroopan kulttuuripääkaupunki (Essen voitti tämän tittelin kilpailun, mutta sitten päätettiin laajentaa se kaikkiin 53 kaupunkiin alue).
Museon uusi rakennus koostuu hissille asennetusta suorakulmaisesta lasikappaleesta; uuden rakenteen ääriviivat muistuttavat jättiläisvasaraa. Kompleksin pohjakerroksessa on aula, joka yhdistää uuden lisärakennuksen olemassa olevaan rakennukseen, sekä tilan erilaisille sosiaalisille tapahtumille. Sieltä kävijät nousevat hissin "torneihin" järjestettyjen hissien avulla näyttelyhalleihin: heitä on 22, 11 kummassakin uudessa kerroksessa. Rakennuksen julkisivu on kaksinkertainen: metallipaneeleista valmistetun pääosan lisäksi se "kääritään" ulkopuolelta läpinäkyvään muovikalvoon; Kahden kerroksen välille muodostuu 1 metrin rako, joka auttaa ylläpitämään jatkuvaa mikroilmastoa hallissa.
Duisburgin viranomaiset tukevat rakentamista täysin: Toinen "ikoninen" rakennus on erittäin hyödyllinen kaupungin satama-alueen uudistamiseksi, joka on ollut käynnissä vuodesta 1991 Norman Fosterin yleissuunnitelman mukaisesti.
Küppersmühlen museon uuden rakennuksen rakentaminen aloitetaan talvella 2009 ja se valmistuu vuoteen 2010 mennessä.
