Itävaltalaiset arkkitehdit voittivat tämän projektin kilpailun jo vuonna 2001, ja sen toteuttaminen ei ollut helppoa: rakennusprosessi keskeytyi kahdeksi vuodeksi, ja sen ensimmäinen vaihe sisälsi yksinomaan paalupohjan rakentamisen (ajettujen paalujen kokonaispituus oli 536 m). Ne olivat välttämättömiä, koska museo pystytettiin heikkoon rannikkoalueeseen - Rhônen ja Sonan yhtymäkohtaan. Confluence tarkoittaa "yhdistämistä"; se on myös koko alueen nimi, joka sijaitsee "nuolen" vieressä (point de confluence, "yhtymäkohta").
Museo on tärkeä rakennus mittakaavassa: mittavan sijaintinsa ansiosta se on "majakka" ja koko uuden Confluence-alueen symboli - entinen teollisuusalue-niemimaa lähellä Lyonin keskustaa, jota rakennetaan nyt kulttuurisen tunnettujen arkkitehtien suunnittelemat laitokset, toimisto- ja asuinrakennukset.
Coop Himmelb (l) au -rakennus sijaitsee vilkkailla jalankulkureiteillä, joten rakennus ei ole esteenä kansalaisten liikkumiselle, joten se rakennetaan maanpinnan yläpuolelle, ja sen alla on "aukio", jossa on ruokailutila.
Confluence-museo koostuu kolmesta osasta. "Sokeriin", jolla yllä mainittu "aukio" sijaitsee, mahtuu kaksi auditoriota (vastaavasti 327 ja 122 paikkaa), tilat läheisten koulujen oppilaille, varastotilat ja työpajat, kokoushuoneet. Glazed Crystal on aula, jossa on spiraaliramppi, portaat ja hissit sekä kirjakauppa. Kolmas ja tärkein tilavuus on ruostumattomasta teräksestä valmistettu "pilvi", jolla on tukirakenne, kuten silta. Siellä on 9 salia (4 pysyvää ja 5 väliaikaista näyttelyä) ja "julkiset" työpajat; ylemmässä kerroksessa on hallintotoimistot, ja katolla on kahvila ja aurinkopaneeleja. Rakennuksen "lentävät" ulokevarret ovat saaneet inspiraationsa vesivirroista, jotka sulautuvat vierekkäin.
Hankkeen budjetti oli 185 miljoonaa euroa (3980 euroa neliömetriltä).